矮化愛飛蘋果苗種與喬花蘋果苗種的差異主要體現在以下幾個方面：
1.樹冠形態不同：矮蘋果樹一般呈圓錐形或圓柱形，樹冠緊湊，而喬木蘋果樹大多是開放或不規則的，樹冠相對鬆散。
2.樹高不同：矮化蘋果樹的高度一般只有樹高的一半左右，這使得矮化蘋果樹更適合密集種植和機械化栽培方法。
3.接穗則不同：矮蘋果樹的接穗一般選擇品質好、產量強、適應性好的品種，如愛飛、金星等，而喬花蘋果樹的接穗多為抗病性強、適應性好的品種，如富士、紅星等。
4.生長潛力不同：矮化蘋果樹的生長潛力較弱，而樹木的生長潛力較強，這使得矮化蘋果樹在相同的時間內更好地積累養分，提高果實品質和產量。
5.不同的修剪方法：矮蘋果樹的修剪方法主要是輕度修剪，通過短枝和疏枝來控制樹冠的大小和形狀，而喬木蘋果樹的修剪主要是重度修剪，通過短枝、疏枝和縮回來控制高度和樹冠大小。
6.不同的適應性：矮化蘋果樹對環境的要求相對較高，需要充足的陽光、水和肥料等條件來保持高品質和高產，而矮化蘋果樹對環境的要求相對較低，能夠在不同的氣候和土壤條件下生長。
一般而言，矮化蘋果樹品種與樹蘋果幼苗品種的差異主要體現在樹冠形態、樹高、接穗、生長潛力、修剪方式、環境適應等方面。 在生產中，應根據實際情況選擇合適的品種進行種植。