冷凍乾燥機採用冷凍乾燥的方法儲存物質，其原理是先將水性物質冷凍成固態，然後直接將物質中的固體水昇華成氣態水，從而達到去除物質中水分的目的。
冷凍乾燥機主要由製冷系統、加熱系統、真空系統、迴圈系統、液壓系統、控制系統、CIP SIP系統和箱體組成。 主要部件有烘箱、冷凝器、製冷機組、真空幫浦、加熱冷卻裝置等。
手動操作一。
1.產品的預凍（前箱的預冷）。
操作方法：開啟迴圈幫浦和壓縮機，30秒後開啟板冷閥。 將產品冷凍至工藝所需的溫度（一般為-35-45左右）。
2、產品預凍後的保溫階段 I
操作：什麼都不做，保持第1階段的狀態，在特殊情況下（有些產品不能冷凍到太低的溫度），所以需要關閉1 2臺壓縮機。 產品達到工藝要求溫度後（一般需要全部3個探頭），溫度將保持一段時間（一般為2-4小時，由工藝要求確定）。
3 關閉板式冷卻閥，開啟冷凝器閥門，將冷凝器溫度降至-45°C以下。 冷凝器預冷（後箱預冷）。
4 預吸塵
開啟真空幫浦、蝶閥，1 2分鐘後，開啟隔膜閥，10至15分鐘後，開啟羅茨幫浦。
5、產品預凍後的保溫階段
在冷凝器的預冷和預真空階段，產品溫度可能會公升高，需要根據工藝要求對產品進行冷藏。
操作方法：在手動凍乾引數中將導熱油的溫度設定到冷拌的所需溫度後，開啟電加熱。 摻雜閥將自動開啟以冷卻導熱油。
6 開始昇華
操作：加熱和保溫根據工藝要求分階段進行。 具體方法：在凍乾的手動引數中設定導熱油的溫度後，設定所需時間，開啟電加熱處理。 導熱油的溫度達到設定值後，保溫時間也達到工藝所需時間後，下一步就是公升溫保溫，以此類推，直至昇華完成。 當前箱的真空度降低到工藝要求的範圍以下（一般在10-30pa之間）時，對產品進行加熱和加熱。
7、產品保溫階段
當產品溫度達到工藝要求的最高溫度時，恆溫為2-4小時（由工藝要求確定）。
8 曝氣階段
操作方法：在凍乾手動引數設定中的洩漏引數設定中，設定曝氣工藝所需的引數，開啟洩漏。 由於後期產品含水率低，箱內真空度過高，導致昇華速度減慢，昇華速度可適當混合，加快昇華速度。
9 確定凍乾是否結束
當第7階段結束時（一般需要3個探頭才能到達），一般來說，可以判斷產品中的水分已經基本昇華（一般要求凍乾產品的水分含量應小於5%-3%），並且還有一種方法可以確定分割槽閥是否關閉， 觀察前箱的真空度變化，如果上公升率與凍乾箱的洩漏率相近，也可以判斷凍乾結束。
自動操作 II.
自動操作一般是根據冷凍乾燥工藝相對成熟後人工操作的經驗進行設定，要求操作人員在設定前對凍乾有一定的了解。
注意：1使用前檢查儀器內腔，乾燥（無液態水）。
2.樣品應冷凍良好，不應有液態水。
3.取出樣品後，應將托盤清潔並用毛巾擦乾。
4.開啟真空幫浦前，注意檢查真空幫浦油的油位和顏色，更換真空幫浦油約500小時。