游離 DNA （CFDNA） 是一種游離 DNA 片段，廣泛存在於人血漿、腦脊液、尿液、胸腔積液、腹水或糞便中。 健康人外周血中CFDNA的濃度大多低於100ng ml，平均約為30 ng ml。 CFDNA 水平在疾病狀態下（例如腫瘤、術後、病毒感染、心血管疾病等）可能公升高。 CFDNA研究受到廣泛關注，因為它們可用於篩選液體活檢和其他臨床研究應用的生物標誌物。 血漿CFDNA研究推動了無創產前診斷（NIPT）檢測技術的發展，CFDNA檢測具有無創、低風險、高精度等優點。 因此，CFDNA在妊娠或臨床疾病的早期診斷、預後和監測方面具有巨大的潛在應用價值。
1、2024年3月1日，法國巴黎Cerba實驗室等單位聯合研究成果發表在《Genetics in Medicine》期刊上（影響因子8822）題為“有和沒有輔助生殖技術的孕婦21三體的游離胎兒DNA與母體血清篩查：一項前瞻性干預研究”。在這項前瞻性干預研究中，科學家們對自然受孕 （SP） 或通過輔助生殖技術 （ART） 的孕婦進行了游離 DNA （CFDNA） 測序和母體血清篩查 （MSS），以篩查 21 三體症候群的發作。
背景：CFDNA多年來一直被用作初步篩選測試，但很少有研究以前瞻性的方式進行**。 據報道，在ART的幫助下，MSS程式對懷孕的檢測準確率低於SP，因此這個問題值得關注。
方法：本前瞻性干預研究旨在研究 CFDNA 和 MSS 在有或沒有 ART 的妊娠期中的表現。 每位志願者都接受了 MSS 和 CFDNA 測試，以篩查胎兒 21 三體症候群。 初步分析佇列共納入794名志願者，其中SP組志願者472名，抗逆轉錄病毒**後妊娠志願者322名。 在這項研究中，Refdi的Labchip GX核酸分析儀用於對CFDNA測序文庫進行質量控制分析。
結果：MSS的假陽性率和陽性**值分別為6.，與兩種檢測方法檢測胎兒21三體症候群的篩查結果相比6% 和 88%，而CFDNA分別為0%和100%。 ART組MSS假陽性率和陽性**值分別為117% 和 2SP 組為 6% 和 32% 和 211%。使用 CFDNA 檢測時，侵入性操作的全球發病率為 19%（15 794），而單獨使用MSS為8%4%（65/794）。
表1MMS和CFDNA對SP組和ART妊娠組21三體症候群的檢測效能比較。
結論：總體而言，胎兒21三體症候群的篩查結果表明，CFDNA對21三體症候群的篩查效能明顯優於MSS。 CFDNA 在 SP 和 ART 妊娠中均優於 MSS，減少了侵入性手術的數量。 這項研究的結果表明，CFDNA應被視為一種主要的臨床篩查方式，特別是在抗逆轉錄病毒治療後進行的妊娠篩查**。
其次，2024年3月12日，法國Life&Soft、AP-HP和Cerba實驗室的合作研究成果發表在《科學報告》（Scientific Reports）雜誌上（影響因子4379）的標題為“使用母體漿漿游離DNA的大規模並行鳥槍法測序在妊娠期間檢測巨細胞病毒DNA：概念驗證研究”。這是一項概念驗證研究，通過對母體血漿 CFDNA 進行大規模平行測序來檢測巨細胞病毒 （HCMV） DNA。
背景：孕婦感染HCMV可導致胎兒先天性感染，對新生兒健康產生嚴重影響。 研究表明，每毫公升血漿中有 1000 1000 億個 DN** 段是無細胞迴圈的。 目前，這類DNA的研究已經延伸到NIPT應用領域。
方法：對27份陽性校準樣本和58份血漿CFDNA陰性樣本進行鳥槍法測序（MPSS），分析測序深度與病毒載量的相關性。 隨後，對 538 名孕婦的人群佇列進行了 HCMV 病毒檢測的驗證性分析，其中 36 名進行了兩次測序，共得出 574 名孕婦的血漿 CFDNA 資料。
在這項研究中，珀金埃爾默的 LabChip GX 核酸分析儀用於 CFDNA 測序文庫的質量控制分析。
結果：本研究表明，在大規模並行鳥槍法測序的NIPT資料中可以檢測到病毒的特定讀數。 此外，校準樣品的病毒載量與參考基因組上比對的reads數之間存在很強的相關性。 基於上述結果，研究團隊構建了乙個統計模型，能夠量化患者樣本的病毒載量。
圖1對一組孕婦的 HCMV 測序結果進行回顧。
a） 538份血漿樣本的原始測序結果摘要;（b） 538份血漿樣品中HCMV樣品的平均深度;（c） 對陽性樣品的讀數進行詳細比較。
結論：推薦使用這種新方法檢測和定量妊娠期迴圈DNA病毒（如HCMV），可用於提高NIPT的診斷水平。
參考資料： 1 costa jm, letourneau a, f**re r, et al. cell-free fetal dna versus maternal serum screening for trisomy 21 in pregnant women with and without assisted reproduction technology: a prospective interventional study. genet med. 2018, 20(11):1346-1353. doi: 10.1038/gim.2018.4.
2. chesnais v, ott a, chaplais e, et al. using massively parallel shotgun sequencing of maternal plasmatic cell-free dna for cytomegalovirus dna detection during pregnancy: a proof of concept study. sci rep. 2018, 8(1):4321. doi: 10.1038/s41598-018-22414-6.
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