段祺瑞內閣期間，國防運動後的權力分配：揭示了省長和省長的任命。
段啟瑞在組建新內閣的同時，也十分重視地方軍政首領的安排。 他首先考慮的是按照兵力進行分配，當時全國的兵力大致可以分為三類：一是北洋軍，包括張作霖、閻錫山等地方軍閥，兵力眾多，占領了東北大半個地區， 華北、西北、華中、華東及華南部分地區;二是進步黨武裝力量和西南勢力，占領雲南、貴州、廣西、四川四省，以及廣東大部分地區和湖南部分地區; 三是國民黨武裝力量，主要集中在湖南、廣東、廣西。
在這三股勢力中，北洋派最為強大，佔據絕對優勢; 西南的強勢派系也擁有一定數量的兵力，並且已經活動了很長時間; 另一方面，國民黨及其軍隊相對鬆散且沒有根據。
特別是山東的中國革命軍東北軍，因為孫中山強烈主張解散軍隊，就已經處於克制階段。
段祁瑞重新任命全國各省的軍政都督，目的是為了穩定北洋派，瓦解西南保護國陣營，加強地方控制，以達到北洋政權的“統一”。
雖然省長、將軍、文官、省長的名字被廢除，改為督、督，但北洋派控制的省級督軍，幾乎還是袁世凱在世時的原班人馬，名單如下：奉天督軍張作霖，吉林省督孟恩元， 黑龍江省長郭宗喜、黑龍江省長畢桂芳、山東省省長張懷志、河南省督孫法徐、河南省長趙琦、山西省督田文烈、山西省督閆錫山、江蘇省督沈明昌、江蘇省長馮國章、齊耀林、 安徽省長張勛，省長倪思充，江西省督察李春，祁陽省長，福建督察李厚基，省長胡瑞林，湖北督察王占元，省長
為了安撫西南勢力派系和進步黨，又不影響未來時機成熟時“統一”南方的雙重目的，段啟瑞在安排南方獨立省份監督人的問題上是用心良苦的。
除雲南監督唐繼瑤、貴州監府劉憲石原為全省將軍外，其他督察、省長均被撤換。
梁啟超等人希望從段祁瑞那裡獲得西南地區軍政都督的職位，但段祁瑞沒有滿足他們的要求，只任命戴環為貴州省長。
梁啟超和進步黨認為戴是傑出的人才，不容忽視，希望他連任湖南省省長。
原文：當天，他還給陸榮庭打了電報，向李元洪、段啟瑞推薦戴歡。 不過，段啟瑞在這個問題上並沒有把進步派放在眼裡。16日，北京**任命劉仁喜為湖南臨時巡撫，作為緩和國民黨反對陳密的臨時措施。
20日，蔡燁向梁啟超表示，願意回老湖南服役休養生息。 梁氏接到電話後，覺得這也是插手湖南的好藉口，立馬打電話給熊希玲，讓段琪瑞鍛鍊一下，讓其落實。
然而，梁的計畫也被段擱置了。 顯然，湖南是南北之間的軍事動脈，如果蔡野在湖南，湖南可能會成為南方的屏障，不利於北洋軍今後的南下。
段氏的內心還是想讓北洋派稱霸天下。 後來，出身漢族，當時在湘軍中實力不強的段軒譚彥敏，暫時出任襄都督，顯然也有其他打算。
段氏還曾計畫任命戴環為湖南調查特使，調和湖南地方勢力與北洋軍之間的矛盾，其實就是要讓進步派趁火而為北洋派。
雖然梁啟超曾極力爭取戴胡擔任湖南省長一職，但此時湖南的局勢已經發生了變化，戴的查處“肯定沒有效果”，只能與各方“有不好的預感”，只好為了戴笠辭去這個職務。
梁啟超對北京**任命蔡燁為四川督，而不是戴環為湖南省長極為不滿。 他向同志們抱怨說：“我們這一代人為大局做了這麼多，如果結果是另乙個，那就太短命了！ ”
從7月6日全國各省的軍政首領任命情況來看，段啟瑞似乎在浙江、四川、廣東等省份問題上，對西南進步派和勢力派做出了一些讓步。
但是，如果我們仔細分析，我們可以看到，這些妥協大多是在面對不利的軍事形勢時被迫做出的。 浙江和廣東就是這種情況。
1916年4月，袁世凱在浙江的部下朱睿、曲應光先後被浙軍文驅逐。 5月6日，盧公旺當選浙江省長，宣布獨立，並按照西南軍的綱領組織浙江保一勝
段啟瑞當然不願意浙江掙脫北洋集團的束縛，但在袁世凱死後南北妥協的局面下，他不願意因為浙江而影響大局。
而且，浙江被北洋勢力包圍，進入的機會很多。 因此，段氏在安排各省軍政長官時，就認清了浙江的現狀，任命呂公旺為浙江的督促和總督。
在廣東方面，段祁瑞的政策是竭盡全力支援龍繼光擔任監督者，但由於各方的強烈反對，未能達到目的。 袁世凱死後的第三天，龍宣布廢除廣東獨立。
當時，李烈軍率領雲南軍隊向廣東北部進發，計畫經韶關進入江西，但駐紮在韶關的龍繼光的真武軍關閉城門，不讓滇軍通過，並在韶關城架設炮兵轟炸雲軍，引發戰爭。
真武軍與滇軍發生衝突後，龍繼光向段啟瑞求助。 段典命令江西將領李淳在江西南部集結北洋軍，準備進攻李烈軍。 但北洋軍還沒動，真武軍已經被滇軍打敗了。
陸榮廷還命令桂軍趁勢從西路攻打三水，將龍繼光困在廣州。 這個時候，如果北洋軍進入廣東，就意味著一場新的內戰。 段啟瑞權衡了一下形勢，覺得自己在政治上或者軍事上沒有把握，所以暫時不得不退後一步。
7月6日，北京任命盧榮廷為廣東省省長，朱慶蘭為廣東省省長，龍繼光被調任梁光礦場監管。 不過，段啟瑞也以陸榮廷本人還在湖南為藉口，命令陸榮廷暫時督軍湖南; 陸到廣州之前，還暫時與龍繼光一起在廣東督軍。
對於與真武軍開戰的滇軍首領李烈軍，段氏沒有給他任何職位，只吩咐他“來京聽他的任命”。 從北京處置廣東的命令來看，段啟瑞還在拖延時間，努力保住龍繼光的廣東督軍之位。
然而，南方各派系，包括梁啟超的進步派，早就恨龍了，堅決反對龍繼續對廣東的監督。 陸榮廷也無視北京臨時代省長**的命令，於7月10日返回廣西。
8月下旬，陸氏率軍進入廣東，以武力迫使龍繼光投降。 龍在貴甸軍的壓力下，被迫放棄了廣州。
湖南是南北軍事紛爭的焦點，段啟瑞本來就立意要贏。 然而，北洋派的得力助手唐千明卻在湖南護法的迫害下被迫逃離長沙，打亂了段啟瑞的計畫。
段某一時出兵不力，匆忙任命逃往湖北西部的陳密為湖南督軍和巡撫。 這一決定遭到了南方各省，特別是湖南的軍民的強烈反對。
程遷率軍進駐長沙後，與曾繼武、趙恆惕等湖南軍將領和各界代表商議，於7月7日選舉劉仁熙為湖南臨時巡撫。
劉仁熙是湖南瀏陽人，曾在廣西當道士，與陸榮廷交情。 程騫等人希望通過他獲得桂軍的援助。 陸榮庭雖然不是乙個樂於助人的老朋友，但湖南是通往兩光的門戶，若是落入北洋軍手中，將威脅到兩光的安全。
出於對自身安危的考慮，陸某表示支援湖南抵制陳宓和項。國民黨和一些湖南將領都歡迎剛從日本回來的黃興擔任湖南省長。
7月14日，程騫、曾繼武、陳富初、趙恆惕、張龍、秦震等人聯名致電李元紅、段啟瑞，要求任命黃興為湖南省省長，“與首都合影留念”。
不過，黃興堅決拒絕，推薦譚彥民或者蔡燁擔任這個職位。 最後，段啟瑞任命譚延民為湖南省省長，其用意如上所述。 在地方權力的分配上，段啟瑞顯然對國民黨持排斥態度。
他不僅拒絕了孫中山和中國革命黨，也拒絕了國民黨的溫和派。 一軍三軍，第一軍司令員蔡毅和三軍司令員唐繼堯分別被授予四川省和雲南省長，但第二軍司令員李烈軍沒有職位。
其他隸屬於國民黨的將領，如熊克武、方勝濤，也被排除在外。 雖然軍事院“作戰決策”的“主要人物”李根被任命為陝西省長，但命令下達後，由於陝西監工陳樹凡的阻撓，他無法就職。
直到次年2月，在李元洪的支援下，李根才到陝西當了不到半年的省長。