1966年，中國進入了乙個特殊的十年。 5月25日，北京大學哲學系黨總支書記聶元子等6名教師在食堂張貼大字報，批評教育系統幹部。
這張大字報引起了廣泛關注，因為它被認為是中國第一張馬克思列寧主義大字報。 6月2日，這張大字報被《人民》雜誌冠以“第一張馬克思列寧主義大字報”，讓聶遠子一夜之間成為那個時代的“名人”。
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有了**的支援，聶遠子的活動更加頻繁了。 1967年1月，他組織人員在《新北大日報》上撰稿發表批評元帥的文章，該報印刷量達55萬份，給元帥的聲譽造成了極大的損害。
1967年4月，北京市革命委員會正式成立，聶元子作為著名的反叛分子和赤衛隊領袖，被選入革命委員會，擔任北京市革命委員會副主任，並晉公升為副省級幹部。
此外，今年他還擔任首都高校紅衛兵代表大會核心組組長，具體指揮北京紅衛兵。
聶遠子身居高位時，多次在北大引發武林鬥毆，導致北大內部形成兩大派系，支援她和反對她，兩大派系圍繞她展開激烈爭鬥，使北大一片混亂。
為了解決這個問題，1968年，**主席決定將勞工宣傳隊和軍事宣傳隊派往各大學，聶元子在北大的權力逐漸減弱。
1969年11月，聶遠子被安排到江西利峪州北大分部農場工作，不久，“五一”運動打響，1971年，聶遠子被押送回北大，接受檢疫審查，1973年，她被安排到北京新華印刷廠工作，兩年後被派往北京大學儀器廠工作。
1978年4月6日，北京大學黨委向北京市委提交了《關於聶元子的審查和處理建議的報告》。 報告中，北京大學黨委建議將聶遠子開除黨籍，並依法依規予以懲處。
隨後，聶遠子被抓獲。 1983年，她被判處17年徒刑，罪名是反革命宣傳和煽動。 7月27日，聶遠子被送往北京市郊的一所監獄服刑。
值得一提的是，儘管聶遠子在監獄各方面都表現良好，但他一直堅稱自己是無辜的。 過了一會兒，她甚至走近監獄長說：“我的案子不是由你決定的，你只是......的執法單位。放心，我會自覺遵守監獄規矩，但我確實是冤枉的，不是反革命分子。 ”
聶遠子的話讓獄長又哭又笑，但她的行為卻如她說的那樣，除了不認罪外，她很優秀，嚴格遵守監獄規矩。
她於1984年保外就醫，此後主要與海淀區的親戚住在一起。 起初，她沒有退休金，但1999年後，她能夠每月從街道辦事處領取600元。
2019年，聶遠子在北京病逝，享年98歲。