CRISPR文庫篩選是一種基於CRISPR Cas9技術的高通量基因篩選方案，通過構建包含數千個sgRNA的文庫並將這些sgRNA轉殖到慢病毒載體中，以低MOI感染靶細胞。 這種方法確保每個細胞僅感染一種型別的sgRNA，從而能夠對不同sgRNA對應的基因進行功能篩選。 我們推薦本月庫存最暢銷的三個CRISPR文庫，並附上該文庫相關研究文獻的解讀，希望能為大家的科研之路貢獻乙份力量
一新陳代謝基因圖書館解碼與三陰性乳腺癌轉移相關的基因
原文鏈結： 乳腺癌是全球危害女性健康的最常見的惡性腫瘤，其高發病率和高死亡率越來越受到關注，其中三陰性乳腺癌佔所有乳腺癌的12-17%。 代謝重程式設計在腫瘤發展中起著重要作用，參與脂質代謝的多個基因也可能參與腫瘤發展，但大多數脂質分子和酶在乳腺癌三陰性轉移分子機制中的作用尚不清楚。
為了研究脂質代謝相關基因與乳腺癌的關聯，研究人員使用了：脂質代謝基因CRISPR敲除文庫篩選甘油二環基激酶（DGKZ）為潛在的轉移前基因，在三陰性乳腺癌細胞系中敲除DGKZ表明，DGKZ在體外和體內均能顯著抑制轉移行為，而DGKZ過表達會增加細胞系的轉移潛力，證實DGKZ高表達與患者腫瘤進展和預後不良有關。 脂質代謝文庫已成功篩選出三陰性乳腺癌轉移相關基因，在探索腫瘤發生和進展方面發揮著關鍵作用，為開發新策略提供了潛在的靶點。
圖1 脂質代謝文庫篩選三陰性乳腺癌轉移相關基因DGKZ
2. 人員轉錄因子圖書館放映腸內分泌細胞顯性抑制劑
腸內分泌細胞 （EEC） 是產生激素的細胞，生長在胃、小腸和結腸的上皮內，調節代謝活動的各個方面，包括胰島素水平、飽腹感、胃腸道分泌和運動。 然而，腸道內分泌細胞的分化過程尚不完全清楚。
為了研究腸道內分泌細胞的分化過程，研究人員使用了：人類轉錄因子crispr敲掉圖書館篩選小腸類器官中的所有轉錄因子，發現ZNF800是控制內分泌細胞命運的顯性抑制劑，通過直接調控PAX4等內分泌轉錄因子網路來限制腸嗜鉻細胞的分化。 CRISPR基因敲除文庫技術發現的內分泌細胞顯性抑制劑ZNF800，不僅增加了我們對腸道內分泌細胞分化的認識，也為未來提供了新的潛在靶點。
圖2 人轉錄因子敲除文庫篩選腸內分泌細胞中顯性抑制劑ZNF800
第三rna組合的蛋白圖書館揭曉調節pd-l1腫瘤免疫逃逸的關鍵因素
原文鏈結： RNA結合蛋白（RBPs）是一類能與RNA結合的蛋白，能識別和結合特定的RNA序列，從而調控基因表達、轉錄、翻譯等過程。 在先前的研究中，已在各種癌症中觀察到 RBP 功能障礙，然而，尚不清楚特定的 RBP 是否通過調節程式性死亡配體-1 （PD-L1） 參與腫瘤免疫逃逸。
為此，研究人員進行了：rna-binding protein淘汰賽圖書館放映研究發現，密度調控重啟釋放因子（DENR）是一種可以調節PD-L1的蛋白質，進一步的研究發現，DENR的缺失會導致PD-L1的表達下降，從而影響腫瘤生長和免疫細胞反應。 DENR 通過拮抗三個連續上游開放閱讀框 （UORFS） 的翻譯抑制和促進 Janus 激酶 2 （JAK2） 的翻譯和 IFN-JAK-STAT 訊號通路的啟用來調節 PD-L1 的表達。 利用RBP CRISPR Cas9文庫篩選系統發現和鑑定新的PD-L1調節因子DENR為理解腫瘤免疫逃逸機制提供了新的視角，也為開發新的腫瘤方法提供了新的思路。
圖3 CRISPR Cas9文庫篩選RBP的關鍵調節因子DENR
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