自來也作為火影三代**的傳家寶，也是木葉村的三位忍者之一，實力當然非常強大。 他也可以使用不朽模式，而且他也應該擁有三忍中最強的戰鬥力。 他一直在四處尋找預言之子。 事實上，他們有很多。 在他的**中，長門和鳴人都被認為是預言之子。 但不知道為什麼，自來也並不在意長門的成長，只是讓他自己成長，什麼都不問。 以至於多年後，長門的性情發生了翻天覆地的變化。
在第三次忍界大戰中，曾經是戰場的雨隱村遭到了其他五個勢力的攻擊。 許多孤兒都是由此誕生的，比如小南、彌彥和長門就是這樣成為孤兒的。 見到他們後，自來也下定決心要為自己的行為贖罪，於是主動留下來教他們忍術，希望他們能夠保護自己，有謀生的手段。 長門和自來也三人一起生活了三年，這三年過得很開心。 自來也三年後離開了，因為他親眼目睹了孩子們的成長，覺得他們不必保護自己。
在和他們在一起的這段時間裡，長門是自來也最愛的人。 長門是輪迴之眼的主人。 我們不要在乎輪迴之眼是怎麼來的。 至少他覺得長門是預言之子。 自來也教了長門很多忍術。 雖然這一切看起來都還好，但自來也三年後離開後，他就再也沒有關心過這三個人了，因為他也有自己的事情，他不得不回到自己的村子裡保護自己的村子，然後大蛇丸叛逃了，自來也也花了很多時間試圖找回大蛇丸。
不過說到長門這邊，他們三人都是受自來也影響的，一開始都非常正派。 長門追隨彌彥，創立了Akatsuki。 他們努力通過自己的努力實現玉音村的和平。 不幸的是，彌彥很快就去世了。 彌彥的死，再加上帶土的影響，長門開始發生變化，他想把九尾獸全部抓捕，讓他們成為威懾其他忍者國家的非常強大的**。 後來，帶土抓住了他們多年努力的成果，發動了第四次忍者大戰。
那麼，如果自來也能夠在彌彥死後及時發現他們的情況並教導他們，是否有可能避免長門太快變黑，甚至根本不變黑？ 畢竟他們小時候，在走投無路的時候，被吉來救了出來，子來也有恩典教他們因果報應。 長門非常信任自來也。 不過可以清楚的看出，自來也對鳴人的喜愛遠大於長門，如果自來也真的相信長門是預言之子，那也就不能侷限於三年的教學。 而且從自來也傳授的忍術來看，他並沒有把長門當成乙個**。 畢竟最具招牌的忍術是延伸到仙術的**系列，還有螺旋丸。 但是他把這些忍術都教給了鳴人，但他沒有教長門。
但確實沒有太多時間關注長門的成長，不久之後大蛇丸因為研究禁術被趕出了木葉村，此後自來也一直在追蹤大蛇丸的行蹤，在追蹤的過程中發現了乙個非常危險的蕭組織。從那時起，他一直在收集有關該組織的資訊。 他真的沒有太多時間去關注長門。 後來，鳴人被教導了，乙個鳴人是自己的徒弟，乙個是鳴人的九尾柱勢力，自來也只是順便和鳴人一起回村子執行任務。 讓他花時間獨自去找長門他們，但他真的沒有這個時間。 所以後來，長門犯了乙個錯誤，成為了蕭組織的首領，這件事真的不能怪自來也。