哈維·阿隆索作為托尼·克羅斯的替代者來到拜仁，但他細膩的腳下技術和出色的組織能力立即給拜仁球迷留下了深刻的印象。 在時任拜仁主帥瓜迪奧拉的帶領下，阿隆索迎來了職業生涯的第二個春天，將他僅存的熱情發揮到極致，成為當時拜仁新的中場核心和領袖之一。
阿隆索在家鄉俱樂部皇家社會首次亮相，在那裡他花了五個賽季將乙個降級區變成了西甲強隊。 阿隆索在2004年以1500萬英鎊的價格從皇家社會被利物浦簽下，並在2005年歐冠決賽對陣AC公尺蘭的比賽中為利物浦打進了決定性的進球，完成了驚人的復出。 最終，利物浦通過點球大戰以總比分6-5擊敗AC公尺蘭，時隔21年再次奪得歐冠冠軍。 第二年，阿隆索依舊狀態出色，幫助利物浦奪得足總盃冠軍。 阿隆索於2009年以3000萬歐元的轉會費加盟皇家馬德里，在此期間，他贏得了2011年西班牙國王盃和2011-12賽季西甲冠軍。 在2013-14賽季，阿隆索幫助皇家馬德里贏得了國王盃和冠軍聯賽，阿隆索在2005年再次加冕後贏得了冠軍。
阿隆索於2014年正式加盟拜仁慕尼黑。 2014-15賽季，阿隆索在德甲聯賽中出場29次，成為拜仁中場不可或缺的球員。 阿隆索本賽季場均觸球138次，其中在拜仁客場2-0戰勝科隆的聯賽第六輪比賽中觸球213次，創造了自1999年德甲有資料以來的新紀錄，而阿隆索70%的長傳成功率讓阿隆索能夠從後場排程球隊的進攻方向。 在接下來的兩個賽季裡，阿隆索的表現越來越強，拜仁年復一年地奪得冠軍。 拜仁在2016-17賽季德甲最後一輪主場4-1擊敗弗賴堡，這場比賽也是阿隆索職業生涯的最後一場比賽。 在拜仁效力期間，阿隆索贏得了三個德甲冠軍，乙個德國盃冠軍和乙個德國超級杯冠軍。
阿隆索的國家隊生涯比他的俱樂部更順利。 阿隆索在2003年首次被徵召到西班牙。 在2008年歐洲盃上，阿隆索隨隊，最終幫助西班牙贏得了德勞內杯。 在2010年世界盃上，阿隆索以西班牙1-0戰勝荷蘭隊，贏得了球隊歷史上的第乙個大力神盃。 在2012年歐洲盃決賽中，阿隆索憑藉出色的表現幫助球隊4-0擊敗義大利隊，衛冕歐洲盃冠軍。 2014年，阿隆索宣布從西班牙國家隊退役，在他的整個國家隊生涯中，阿隆索一共為西班牙隊出戰了114場比賽，打進16球，幫助西班牙連續三屆奪得重大賽事冠軍，是西班牙王朝的重要奠基人之一。