近日,中國農業科學院鄭州果樹研究所士多啤梨種質改良團隊、深圳市農業基因組研究所聯合發布了八倍體士多啤梨端粒-端粒基因組,系統分析了八倍體士多啤梨亞基因組的結構和遺傳分化,分析了該亞基因組的表觀遺傳進化機制。 研究結果發表在《園藝研究》上。
記者了解到,該研究以紅巖士多啤梨為材料,從頭將八倍體士多啤梨端粒組裝到端粒基因組中,共鑑定出ABCD的4個亞基因組等109320個基因。 通過構建系統發育樹,發現B、C、D亞基因組是第乙個被引入八倍體基因組的亞基因組,A亞基因組是最後乙個直接祖先供體。
分析表明,亞基因組A的CG、CHG和CHH甲基化水平最低。 亞基因組A的偏向表達基因高於其他亞基因組,且A偏向表達的同源基因大多為基因體甲基化(GBM)。 本研究為士多啤梨基因功能挖掘、抗性分子育種和品質改良的後續開發提供了理論和資料支撐。
該研究得到了國家重點研發計畫、中國農業科學院科技創新專案和河南省重大科技專項的支援。
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