秦始皇統一六國，秦全面實行縣製。 它分為36個縣和京畿道地區，由內史直接管理。 統一初期，秦始皇將全國劃分為36個縣，後來增加到46個縣。
《秦朝記載》和《秦始皇記載》都提到，在始皇帝在位26年（西元前221年）初，天下被併入36個郡，但36個郡的名稱沒有列出。 《漢書地理志》中景昭尹押注“古秦內史”，在各縣押注“秦志”、“秦縣”或“古秦縣”，有以下36個縣：河東、太原、上黨、三川、東軍、迎川、南陽、南軍、九江、泗水、鉅鹿、齊縣、郎溪、惠濟、漢中、蜀縣、巴縣、隴溪、北堤、上君、九園、 雲中、雁門、代君、上古、於陽、有北平、遼溪、遼東、南海、桂林、湘君、邯鄲、當軍、薛縣、長沙。
譚啟祥出版《秦君新考》，核實秦軍范德四十六年的內史。 其中，“漢志”中命名的32個縣，分別是：上君、八郡、漢中、蜀郡、河東、隴西、北堤、南郡、南陽、上盪、三川、太原、東郡、雲中、雁門、營川、邯鄲、鉅鹿、上古、於陽、尤北平、遼溪、當軍、泗水、遼東、岱郡、徽集、長沙、齊郡、郎西。 前中、光陽、陳君、民中四個郡彌補了“漢志”的不足，將36個郡連線起來，《史記》說，始皇在20年將天下劃分為36個郡。 南海、桂林、湘郡、九元四縣的名稱見於《漢志》，始皇帝於三十三年開封胡、越。 東海、長山、冀北、膠東、河內、衡山六個縣，“漢志”不見了，始經26年，始皇將其置於縣內。 筆者根據《史記》和《漢》編年史，將上述四十六縣判定為秦縣，但他也說：這並不意味著秦縣必須侷限於這四十六縣，因為《史記》中沒有秦縣的編年史，秦世代的所有縣都未必在編年史中能找到。
京畿道內史咸陽縣，轄41個縣：咸陽縣、品陽縣、崇泉縣、寧勤縣、下台縣、高陵縣、藍田縣、杜縣、志陽縣、雲陽縣、廢山縣、胡縣、梅陽縣、臨津縣、懷德縣、義縣、習縣、尚縣、永縣、溧陽縣、鄭縣、立義縣、扎柴島縣、懷裡縣、 尋義縣、昊陽縣、昊縣、黃縣、齊縣、商洛縣、雅縣、夏陽縣、益陽縣、武城縣、豫縣、豫縣、川四空縣、胡縣、陳倉縣、鄭縣。
隴西縣縣轄迪島縣，轄21個縣：迪島縣、習縣、蘭幹縣、洛陽縣、上台縣、吉縣、迪島縣、古道縣、臨濤縣、正島縣、綿竹縣、湘武縣、阿陽縣、下班縣、邊島縣、榮島縣、武都島縣、玉島縣、博道縣、承濟縣、曹漢縣。
北國縣轄義渠縣，轄義渠縣、殷密縣、安武縣、彭陽縣、方渠縣、倪陽縣、魯縣、玉之縣、長武縣、烏石縣、嚮導縣、涇陽縣、潮納縣、結島縣、洛盤縣等15個縣。
上縣縣轄撫石縣，轄21個縣：撫石縣、揚州縣、元陽縣、高奴縣、啟源縣、廣研縣、羅都縣、定陽縣、釣魚區、元都縣、平度縣、土井縣、平州縣、中央縣、西都縣、武庫縣、平陸縣、饒縣、博嶺縣、白土縣、富昌縣。
久原郡該縣轄九源縣，轄九源縣、河陰縣、武都縣、習縣、南嶼縣、滿波縣、墨縣、祁陽縣8個縣。
雲中縣縣治雲中縣，下設雲中縣、祥陰縣、咸陽縣、元陽縣、北嶼縣、鎮陵縣、武泉縣、沙嶺縣、羅縣12個縣。
三河郡縣轄洛陽縣，轄洛陽縣、胡安縣、新安縣、華陽縣、益陽縣、魯市縣、烏石縣、平陰縣、新城縣、陝西縣、蛟縣、河南縣、滎陽縣、荊縣、城高縣、楊武縣、梁縣、中木縣、貢縣、古城縣、黃池縣、倫氏縣22個縣。
永川郡全縣轄楊寨縣，轄楊寨縣、滎陽縣、相城縣、新鄉城縣、鄢陵縣、徐縣、陽城縣、長社縣、新富城縣、大路縣、新鄭縣、尉石縣、舞陽縣、賈縣、承安縣、雲縣、鶯鶯縣、定陵縣、咸陽縣、密縣、元嶺縣、昆陽縣、應縣。
南陽縣全縣轄萬縣，轄27個縣：萬縣、鄴縣、鄧縣、彩陽縣、豫縣、碧陽縣、樂城縣、魯陽縣、博望縣、殷縣、信隱縣、南嶺縣、湖陽縣、李縣、隋縣、新業縣、李縣、平石縣、野雞縣、陽城縣、福縣、新都縣、山都縣、 竹陽縣淡水縣。
東縣濮陽縣，轄26個縣：濮陽縣、定濤縣、濟陰縣、東崢縣、桃林縣、李秋縣、曹縣、東吳陽縣、白馬縣、城陽縣、燕縣、蘇藻縣、聊城縣、卓平縣、陽平縣、鎮城縣、敦丘縣、獨官縣、成武縣、長垣縣、萬曲縣、平秋縣、成縣、巨玉縣、清石縣、 和徐縣。
薛縣縣治魯縣，轄魯縣、武巖縣、任城縣、薛縣、范縣、平陸縣、方虞縣、鄒縣、寧陽縣、文陽縣、卞縣、城縣、銀平縣、簡陽縣、平陽縣、崗縣、滕縣、虎嶺縣、建丘縣、康福縣、許昌縣、柴縣。
吉北縣縣治魯縣，轄魯縣、樂陵縣、亞羅縣、阜陽縣、高里縣、前通縣、齊縣、洛音縣、平遠縣、博成縣、東坪嶺縣、半陽縣、梁鄒縣、玉嶺縣、泰山縣、平陽縣、鯉城縣、應縣等18個縣。
臨淄縣臨淄縣轄10個縣：臨淄縣、臨朐縣、苗城縣、樂安縣、東安平縣、狄城縣、博昌縣、常果縣、高灣縣、前城縣。
膠東縣即墨縣，轄即墨縣、長陽縣、鄴縣、黃縣、宣縣、東木縣、長武縣、臨朐縣、高密縣、平壽縣、下湘縣、都昌縣、新城縣、春餘縣、顧縣等16個縣。
琅琊縣縣治郎溪縣，轄11個縣：郎溪縣、迪縣、東吳縣、贛榆縣、步其縣、吉縣、裒縣、南武縣、高陽縣、洋都縣、巨陽縣。
黨軍縣轄黨縣，轄黨縣、莽縣、夏義縣、錢縣、旗峰縣、淇縣、陳流縣、綏陽縣、禹縣、永秋縣、外黃縣、山父縣、濟陽縣、孟縣、豫縣、湘義縣、顧縣、大良縣、豫縣、湛旗縣、昌邑縣、東義縣22個縣。
陳軍縣治陳縣，轄27個縣：陳縣、陽安縣、汝陽縣、南墩縣、如茵縣、昌平縣、新彩縣、沈縣、哲縣、平餘縣、陽夏縣、信義縣、信陽縣、豫縣、朗陵縣、庫縣、鄯善縣、西平縣、上菜縣、城陽縣、安陽縣、趙嶺縣、固陵縣、 斯利普縣、湘縣、安嶺縣。
東海郡縣治潭縣，轄18個縣：譚縣、棠義縣、酉陽縣、建陵縣、蘭陵縣、海陵縣、新東陽縣、東陽縣、霞邋縣、博景縣、鄒旗縣、張縣、盱眙縣、淮陰縣、廣陵縣、靈縣、湘本縣、曲縣。
泗水縣轄湘縣，轄25個縣：沛縣、湘縣、阜陽縣、富里縣、夏鄉縣、多縣、宣佑縣、宣縣、豐縣、洪縣、平阿縣、徐縣、魯縣、彭城縣、豫縣、夏才縣、山桑縣、齊縣、江丘縣、豫縣、成福縣、竹義縣、蕭縣、 祁縣留縣。
河東縣全縣轄安義縣、蒲幹縣、分音縣、地竹縣、皮市縣、臨汾縣、江縣、於縣、左義縣、平陽縣、新香嶺縣、惠澤縣、豐縣、元縣、楊縣、普子縣、北庫縣、宜石縣、土軍縣等19個縣。
河內縣全縣轄淮縣，轄淮縣、溫縣、義縣、武德縣、曲陽縣、秀武縣、行丘縣、野王縣、貢縣、山陽縣、潮歌縣、吉縣、河陽縣、當陰縣、龍溪縣、安陽縣、周縣、內黃縣、范陽縣。
上黨縣縣治長子縣，轄長子縣、屯流縣、桐廬縣、香源縣、魯縣、玉武縣、端市縣、西市縣、渾市縣、高渡縣、聶縣、虎關縣、社縣等13個縣。
邯鄲縣縣轄邯鄲縣，轄邯鄲縣、武安縣、山西縣、益陽縣、新都縣、鄴縣、廣平縣、銀安縣、魏縣、烏石縣等11個縣。
太原縣，晉陽縣，轄21個縣：晉陽縣、大嶺縣、習縣、益陽縣、紫石縣、平濤縣、高狼縣、上愛縣、林縣、梨石縣、榆次縣、齊縣、中都縣、楊曲縣、郎蒙縣、吳縣、陽義縣、仙嶼縣、霍仁縣、餘縣、介秀縣。
衡山縣縣轄東源縣，轄東源縣、十一縣、努魯縣、樂陰縣、上曲陽縣[注38]、宜安縣、壽嶺縣、元石縣、豪斯縣、庫井縣、安國縣、新楚縣、奉泗縣、九門縣、平台縣、菁井縣、寧壽縣、南興塘縣、望都縣、唐縣、北平縣、曲義縣。
鉅鹿縣鉅鹿縣，轄24個縣：鉅鹿縣、陽市縣、松子縣、城鄉縣、萍鄉縣、任縣、下渠陽縣、下波縣、武義縣、南宮縣、東陽縣、青陽縣、東武城縣、措縣、樂城縣、張武縣、高陽縣、南陂縣、安平縣、溫縣、莒縣、忠義縣、阿武縣、婺源縣。
雁門縣縣治山武縣，轄山武縣、平城縣、馬邑縣、新城縣、樓府縣、禾陽縣、崔縣、范奇縣、望濤縣、黎縣10個縣。
戴郡縣治傣縣，轄傣縣、當城縣、炎陵縣、新平墅縣、平邑縣、東安縣、元陽縣、鹿城縣、半石縣、申河縣、高流縣等11個縣。
上谷縣縣轄阜陽縣，下設阜陽縣、宜餘縣、寧城縣、鈞都縣、上蘭縣、居庸縣、潘縣、儒縣、夏居縣10個縣。
榆陽縣縣轄於陽縣，轄於陽縣、泉州縣、白壇縣3個縣。
光陽縣縣轄薊縣，轄薊縣、范陽縣、梁鄉縣、義縣、榮成縣、城縣、卓縣、防城縣、安次縣9個縣。
右北平縣全縣轄吳中縣，轄吳忠縣、長城縣、西陽縣、薛縣、廣城縣、白狼縣、徐武縣、紫縣、石城縣9個縣。
遼溪縣縣轄鄂樂縣，轄鄂樂縣、土河縣、柳城縣、靈芝縣、安平縣、海陽縣、飛如縣7個縣。
遼東縣縣治湘平縣，轄湘平縣、仙前縣、後城縣3個縣。
漢中縣縣轄南鄭縣，下設南鄭縣、西城縣、城固縣、上庸縣、習縣、雲陽縣、芳嶺縣、福縣、滇陽縣、安陽縣、昌黎縣、武陵縣12個縣。
蜀縣縣治成都縣，轄18個縣：成都縣、瓊縣、嘉孟縣、白水縣、茅坻路、舞陽縣、臨瓊縣、雁島縣、青衣路、綿餘路、新都縣、齊縣、梓桐縣、店地路、平樂縣、福縣、郫縣、郫縣銀平路。
巴縣縣屬江縣，轄江縣、閬中縣、通縣、豫縣、曲仁縣、臨江縣、涪陵縣、安漢縣、丹曲縣、江陽縣、滇江縣等11個縣。
南縣縣治江陵縣，轄江陵縣、安魯縣、綦江縣、當陽縣、沙縣、英縣、雁縣、品縣、宜島縣、左雲盟縣、右雲夢縣、臨福縣、以陵縣、周陵縣、景陵縣、胡安縣、宜魯縣、鄴縣、梧縣、紫桂縣、吳縣20個縣。
衡山縣縣治宜縣，轄義縣、西嶺縣、鄂縣、齊斯縣、益陽縣5個縣。
長沙縣臨鄉縣轄16個縣：臨鄉縣、益陽縣、夏君縣、艾縣、醴陵縣、羅縣、玲嶺縣、陳縣、耒陽縣、冷島縣、重陵縣、桃陽縣、官陽縣、貴陽縣、道道縣、遊縣。
千中縣縣轄臨源縣，轄黔靈縣、酉陽縣、臨源縣、楊凌縣、凌嶺縣、昆陽邑縣、小嶺縣、索縣、荊陵縣、溧陽縣、元嶺縣等11個縣。
九江縣壽春縣，轄13個縣：壽春縣、曲陽縣、李縣、溧陽縣、鹽樓縣、安豐縣、蜀縣、銀嶺縣、東城縣、鐘裡縣、簡陽縣、六縣、菊潮縣。
槍槍縣治燕縣，轄閻縣、江城縣、莫陵縣、丹陽縣、佘縣、彝縣6個縣。
惠濟縣縣治吳縣，轄吳縣、武城縣、鄢陵縣、浙江縣、海鹽縣、墨陵縣、富春縣、丹徒縣、錢塘縣、餘杭縣、遊泉縣、山陰縣、諸暨縣、武術縣、太默縣、巨章縣、餘姚縣、上虞縣、江城縣、丹陽縣、婁縣、陽縣、曲阿縣、 尹縣、彝縣、佘縣、郫巖縣。
廬江縣縣轄盤陽縣，轄興安縣、盤陽縣、舞陽縣、廬陵縣、安平縣5個縣。
民中縣縣治東業縣，轄1個縣：東業縣。
南海縣縣治番禺縣，轄番禺縣、龍川縣、揭陽縣、博羅縣、南海縣5個縣。
桂林縣該縣轄布山縣，轄布山縣、四會縣、竹鹿縣、老義縣、鍾流縣、蒼梧縣、英浦縣、南平縣8個縣。
大象縣縣治臨辰縣，轄臨辰縣、祥林縣2個縣。
雲貴地區的夜郎和雲南民族地區。