加里曼丹島是世界第三大島，北與馬來西亞砂拉越和沙巴州接壤，東與東南亞小國汶萊接壤南部屬於印度尼西亞，分為加里曼丹四個省：東部、南部、中部和西部。 印度尼西亞建國後，吞併了東帝汶，也盯上了新加坡。 針對加里曼丹北部（現為馬來西亞的一部分）的領土爭端，印度尼西亞對馬來西亞發起了“對抗運動”。
印尼獨立後，為什麼不直接吞併加里曼丹呢？原因源於歷史。 印度尼西亞是荷蘭的殖民地，而馬來西亞是英國的強國。 印度尼西亞繼承了荷屬東印度群島，與印度有相似之處。 從歷史上看，印度尼西亞一直是一群彼此不屬於的小王國，不是乙個統一的國家。 荷蘭人將馬來群島的大部分地區合併到荷屬東印度群島，以方便統治。 然而，荷蘭人只占領了加里曼丹的南部，對汶萊和英國殖民地無能為力。 英國和荷蘭爭奪加里曼丹島，汶萊萎縮，荷蘭占領南部，英國控制了這兩個州和汶萊。
荷蘭人要保住荷屬東印度群島並不容易，從英國人那裡獲得更多收益的希望渺茫。 印度尼西亞比馬來西亞更早成立，雄心勃勃，瞄準其外圍。 印度尼西亞是東南亞最大的國家，除了殖民地外，周圍都是小國，類似於印度。 在印度尼西亞第一位**蘇加諾任職期間，該辦公室懸掛著Majak Pacher帝國的地圖，突出了蘇加諾的政治野心。 在印尼人心中，加里曼丹北部的砂拉越和沙巴，在脫離英國殖民統治，回歸偉大的馬賈克巴赫帝國後，應該併入印尼。
但是，印尼不敢輕舉妄動，畢竟印尼在英國面前沒有獲勝的把握。 當英軍撤退迫在眉睫時，印尼以為時機已經成熟，卻發現英軍在印尼沒有動靜，英國殖民地選擇聯合起來組建馬來西亞。 起初，馬來西亞聯邦包括新加坡甚至汶萊，但汶萊最終拒絕了，新加坡退出了。 英國此舉在印尼引起了極大的不滿，甚至與擁有沙巴主權理念的菲律賓聯合起來。 對印尼來說，乙個統一的馬來西亞構成了威脅，尤其是印尼對加里曼丹北部的覬覦。 如果這兩個國家併入馬來西亞，局勢將失控，印度尼西亞甚至寧願退出聯合國作為姿態。 經過三國協商，印尼同意沙巴和砂拉越的命運應由當地人民決定，相關地區人民的意願將由聯合國調查確認。 因此，大多數人選擇加入馬來西亞。 印尼不滿，拒絕承認馬來西亞，兩國爆發激烈示威，甚至美國的斡旋也未果。 直到印尼更迭後，兩國關係才逐漸趨於和平。