蛋白質測序資料型別分析

蛋白質測序通常是指確定蛋白質的氨基酸序列。 這涉及對蛋白質的氨基酸進行測序，以確定它們在蛋白質中的確切順序。 蛋白質測序的資料結果可以描述為以下資料型別：

1.氨基酸序列：

這是蛋白質測序的主要輸出，表示為 20 個標準氨基酸單字母的字串**。 例如，乙個小的蛋白質片段可能具有序列“mgsdki”。

2.質譜資料：

如果使用質譜法進行蛋白質測序，則獲得顯示不同質荷比和相對強度的質譜圖。 這有助於確定氨基酸片段的質量和組成。

3. 疊加地圖或對映：

這顯示了已測序的蛋白質片段如何對映回整個蛋白質。 這可以幫助研究人員了解已經鑑定了多少蛋白質序列以及哪些區域仍未鑑定。

4. 置信度得分：

對於每個已識別的氨基酸位置，可能有乙個置信度評分，用於指示該位置的氨基酸身份的置信度。

5. 其他注意事項：

這可能包括已知的翻譯後修飾、亞基資訊、已知結構域等。

通常，氨基酸序列資料可以以簡單的文字格式儲存，例如FASTA格式。 然而，質譜資料通常以特殊格式儲存，例如： mzml、.mzxml 或。 RAW 格式。