當傳記作者研究牛頓的生平並撰寫他的傳記時，牛頓已經不在人世了，所以他們沒有必要隱瞞他的宗教傾向。 但讓早期傳記作家扼住喉嚨的是牛頓圖書館裡的大量書籍，以及他留下的大量手稿和筆記，其中許多都包含令人難以置信的資訊。 這一切清楚地表明，儘管他是歷史上最受尊敬的科學家之一，是創造科學方法的典範，但他一生在煉金術上花費的精力遠遠超過了純科學的努力。 這些訊息來源也證實，牛頓的知己中很少有人發現他的秘密，也沒有人知道他花了這麼多時間研究聖經的年表和預言，尋找自然界的魔法。 更重要的是，他實際上試圖探索煉金術的秘密，即精神中的精神。
牛頓的早期傳記作者認為，兩種截然不同的性格不能共存，當他們發現任何會玷汙和困擾牛頓性格的材料時，他們不得不將其偽裝成某種特殊的怪癖或一時的精神錯亂。 布魯斯特將牛頓關於煉金術的大量文獻描述為“只不過是傻瓜和庸人的消遣”。
直到1936年，牛頓的真面目才被揭開：他是乙個總是緊張、焦慮、怪異和衝動的人。 那一年，一本關於牛頓的論文集在蘇富比拍賣行拍賣，大約50年前，劍橋大學接受了捐贈，並認為該收藏品“沒有科學價值”。 當時，它們被傑出的經濟學家和牛頓學者凱恩斯在拍賣會上買下（10年後，凱恩斯在臨終前將它們遺贈給了劍橋大學國王學院）。
1942 年，凱恩斯在研究了這些關於牛頓的秘密檔案（手稿、筆記等，被聖徒傳記忽略）後向皇家學會發表講話，將歷史上最著名和最崇高的科學家描繪成乙個完全不同且極具爭議的人物。
自18世紀以來，牛頓一直被認為是第一位也是最偉大的現代科學家，他是一位理性主義者，他教會我們冷靜地思考和不偏不倚地推理。 但我現在要說的是，我不這麼認為，我不認為有人在讀完那箱檔案後，會認為他是乙個道德高尚的偉人。 這箱檔案是牛頓在1696年離開劍橋大學時收集的，雖然其中一些已經丟失，但其中一些已經留在我們手中。 牛頓不是理性時代的第乙個人，但他是最後的魔術師，最後的巴比倫人和蘇美爾人。 他是最後一位偉大的智者，他以與近萬年前開始構建我們知識遺產的人相同的目光來尋找可見的、可知的世界。 牛頓出生於 1642 年聖誕節，是一位寡婦，是一名馬奇人。