CROT重組蛋白結構解析的實驗過程

Mondo 科學 更新 2024-02-19

1.crot重組蛋白的基本資訊:

肉鹼O-辛醯轉移酶(Crot)是一種重要的酶,在脂肪酸代謝中起關鍵作用。

Crot 蛋白來源於 crot 基因的轉錄和翻譯,含有 758 個氨基酸殘基。

這種蛋白質在軟骨體內表達,主要參與長鏈脂肪酸的氧化過程。

巴豆醣酶的缺失或異常可導致脂肪酸**在微軟骨中積累,進而導致肌肉無力和其他脂肪酸代謝相關疾病。

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2.試驗設計:

第 1 步:轉殖和構建 crot 基因。

從適當的生物樣品中提取總RNA,並通過逆轉錄聚合酶鏈反應(RT-PCR)製備Crot基因的互補DNA(cDNA)。

CDNA與適當的表達載體(如PET28A)連線,以獲得Crot基因的可表達質粒。

進行序列分析以確認凝塊基因插入質粒的正確性。

第 2 步:表達和純化 COROT 重組蛋白。

將COToT基因插入到表達BL21(DE3)等宿主菌株的大腸桿菌中,在IPTG誘導下表達重組蛋白。

通過超聲波破碎等方法破壞細胞並獲得細胞裂解物。

親和層析柱,如鎳親和層析柱,用於從細胞裂解物中純化重組蛋白。

通過聚丙烯醯胺凝膠電泳(SDS-PAGE)和Western blot驗證了純化的COToT重組蛋白的純度和表達水平。

第 3 步:驗證 COROT 重組蛋白的活性。

為了分析克羅特酶的活性,可以使用諸如巴雷特反應之類的測定法通過測量生成的巴雷特酸的光密度來定量評估酶活性。

此外,高效液相色譜(HPLC)可用於檢測不同底物的降解產物,以驗證COToT重組蛋白在底物上的催化活性。

第 4 步:crot 重組蛋白的結構解析。

採用X射線晶體學或核磁共振(NMR)技術闡明COROT重組蛋白在結晶或溶液狀態下的結構。

通過結構分析,了解了COTase的催化機理、底物結合位點和潛在的抑制劑結合位點。

通過這些實驗,我們能夠轉殖、表達、純化和驗證COROT重組蛋白的活性,並進一步闡明其三維結構,為深入研究其蛋白功能和潛在的藥物設計提供了基礎。

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