1959年，他被提拔為行政長官，張愛萍申請調職。 原來，張愛平曾寫信要求調職，因為抗美援朝戰爭後需要精簡和重組我們的事務。
然而，他後來意識到自己的舉動可能引起了誤會，所以他改變了主意。 誤區的根源在於五大軍種的退出和合併。 當時，中國面臨著發展經濟建設的重任，軍費和政府開支不得超過國家財政的30%。
** 決定再次精簡和重組武裝部隊，將武裝部隊總兵力減少20%，將軍費開支從34.2%減少到25%以下。
張愛萍發現公安大軍的存在有些多餘，決定取消公安大軍和領導班子的人數。 雖然有人認為張愛萍因此得罪了公安軍司令員、政委，但事實並非如此。
防空不僅依靠地面高射炮，還需要戰鬥機航空的配合。 但是，我們的防空部隊沒有任何飛機，如果需要使用，需要從空軍借用，包括飛機、機場、雷達、氣象、服務等。
張愛萍對此感到失望，提議將防空部隊併入空軍，空軍主導地面防空任務。 雖然***同意了這個提議，但他還是讓張愛平先說服防空部隊司令員兼副總司令楊成武。
不過張愛平幾次去找楊成武都沒能找到，只能和防空部隊副司令員程軍等人談判，都同意取消防空部隊的合併。
張愛平認為楊成武也會同意這個建議，因為他是大局觀的老革命家。 於是，張愛平去找空軍司令員劉亞樓，希望他接手防空部隊，劉亞樓爽快地答應了。
就這樣，中央軍委正式開會討論廢除防空部隊合併的問題。 不過，楊成武對此並不滿意，一見面就生氣了，說：“你想吃我？ 歷史上只有我的部隊吃過別人，沒有人敢吃我！ ”
張愛萍脾氣火爆，**稱她為“愛犯罪”，*稱她為“無緣無故”。 他聽到楊成武的話，氣得一拍桌子站了起來，大聲訓斥道：“我找了你好幾次，你躲起來就消失了，今天你又說了這麼無理的話，告訴你今天我要除掉你！ ”
張愛萍憤怒的吼聲打亂了會議的秩序，無法繼續下去。 然而，經過反覆研究，中央軍委最終決定接受張愛平撤出併排防空部隊的計畫。
1957年1月，軍事委員會召開擴大會議，宣布取消防空部隊，將其併入空軍，建立新的綜合防空系統。 楊成武也反駁不住，欣然接受了軍委的決定。