撫順戰敗、城陷的訊息震驚了明朝朝廷，明神宗多年不理會朝廷，這時卻驚呼道：“遼作軍陷落，國家戰火紛飛，邊事十分危急。 為了徹底消滅後晉，明朝聯合女真葉和部、朝鮮王朝，在後晉天命四年（明朝萬曆四十七年，1619年）對後晉發動全面進攻，薩爾胡之戰即將爆發。
在這場關係到國家生存的大戰役中，大貝爾代山命令黃太極率領白黃白紅四旗右翼，向吉林崖西路的杜松軍發起進攻。 戴山親自率領左翼黃、紅、藍、藍四面旗幟，負責監視和阻擊薩爾胡的明軍。
努爾哈赤親自前往前線，觀察明軍的陣型，果斷改變大山的作戰部署。 他親自指揮，率領正黃、紅、藍、藍五旗率先攻打薩爾胡明軍，同時命令皇太極等人率領正白、白、紅三旗監視、阻擊吉林崖的杜松軍。
努爾哈赤在薩爾胡成功殲滅明軍後，迅速返回與皇太極部落會合，共同在吉林崖向明軍發起猛烈進攻。 皇太極英勇無畏，率先衝鋒陷陣，展現出出突出的戰鬥天賦。 在皇太極的帶領下，後晉軍如竹，明軍戰敗，主將杜松戰死在戰場上。 將軍龔念遂率領部分敗軍殘餘，匆匆逃往虎渾和埃莫。 後進軍打勝第一仗，士氣大振。
努爾哈赤和皇太極趁著勝利追擊，北上迎戰北路明軍，由大兵馬麟指揮。 三月初二清晨，皇太極親自率領1000名精銳士兵攻打虎渾、峨墨的宮念穗。 他巧妙地運用戰術，以騎兵突破敵軍防線，步兵緊隨其後，摧毀敵人的戰車。 明軍抵擋不住後晉軍的猛烈攻勢，戰敗逃竄。 龔念綏等將領在激戰中英勇犧牲。
緊接著，黃太極率軍進入馬林駐紮的上劍崖戰役。 在皇太極的指揮下，後進軍再次展現出強大的戰鬥力，明軍紛紛撤退，最終敗逃而逃。 馬林倖免於難，狼狽地逃回了開原。 至此，後津軍在薩爾胡戰役中屢戰成勝，取得了輝煌的勝利。
第六，皇太極英勇指揮，後金再次擊敗明軍。
三月初四拂曉，努爾哈赤回到赫土阿拉，立即召見竹別勒大臣，商討會合劉魏軍隊的策略。 他命令戴山、皇太極等人率領八旗軍到東線迎擊明軍，而他則留下四千人馬護河圖阿拉，同時在南線阻擊李如白的明軍。
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中午時分，戴山和皇太極率兵出發，很快發現明軍在阿布大理崗。 戴山原本打算親自率兵攻占阿布大理崗以東的山，然後從山上進攻，但黃太極上前阻止他，並提出率兵上山進攻的建議。 戴山答應後，皇太極迅速率領右翼的四面旗幟占領了東山。
皇太極挑選了三十名精銳騎兵從山上衝入敵陣，英勇出手砍殺，但未能立即取勝。 緊接著，戴山率領四旗親自趕往明營，雙方展開了激烈的混戰。 在皇太極和戴山的聯合攻勢下，明軍一團亂麻，最終潰敗。 黃太極率軍掩護追擊逃跑的明軍。
劉偉率領明軍第二營迎戰。 黃太極抓住劉玲陣法的缺口，趁勢進入敵陣。 經過一番激戰，劉偉戰死在戰場上，全軍全軍覆沒。 朝鮮將軍康弘利見狀投降了。 皇太極在薩爾胡戰役中再次立下了大功。
後晉天命十年（明朝五年，1625年），黃太極和弟弟阿巴臺率領5000名精銳騎兵援送科爾沁，成功逼迫察哈爾蒙古首領林丹汗逃走。