專案職業健康安全管理體系分為三同步系統、安全預評估系統、應急預案與事故處理系統、事故與職業病統計報告與處理系統四部分。
1.三同時系統。
“三同時”制度是指我國實施新建、改建、擴建、建設專案和技術改造和技術引進專案，其職業健康安全設施必須符合國家規定的標準，必須與主體專案同時設計、建設、投產使用。 對安全設施的投資應包括在建設專案的概算中。 職業健康安全設施主要指安全技術設施、汙染防治設施、勞動安全衛生設施、職業病預防設施等。
2.安全預評價制度 預評價制度是以專案可行性研究報告的內容為基礎，採用科學的評價方法，根據國家法律法規和行業標準，分析專案存在的情況、有害因素的種類和危險程度、危害性，提出科學、合理、可行的職業安全衛生技術措施和管理對策， 作為專案勞動安全衛生設計與工程專案勞動安全衛生管理初步設計的主要依據，首先作為綜合生產管理部門進行審核時的參考。
3.應急預案及事故處理
1）生產安全事故應急預案 應急預案是發生具體潛在事件和突發事件時應採取的措施的規劃和安排，是應急響應的行動指南。制定應急預案的目的是防止在發生緊急情況時出現混亂，並按照合理的響應程式採取適當的救援措施，以防止和減少隨之而來的職業健康和安全以及環境影響。
2）安全生產事故應急預案管理。
4.**事故和職業病統計報告和處理系統。
根據人員造成的生產安全事故（以下簡稱事故）或直接經濟損失，一般分為以下幾級：（1）特別嚴重的事故，是指造成30人死亡以上，或100人以上重傷（含急性工業中毒，下同），或直接經濟損失1億元以上的事故; （二）重大事故，是指造成10人以上30人以下死亡，或者50人以上100人以上重傷，或者直接經濟損失5000萬元以上1億元的事故; （三）較大事故是指造成3人以上10人以下死亡，或者10人以上50人以下嚴重受傷，或者直接經濟損失在1000萬元以上5000萬元以下的事故; （四）一般事故是指造成3人死亡、10人以下重傷或者直接經濟損失在1000萬元以下的事故。 術語“以上”包括這個數字，術語“下面”不包括這個數字。