MIMIC資料提取教程:患者入住ICU後如何提取第乙個WBC和SpO2值

Mondo 科技 更新 2024-01-31

要閱讀本文,建議先閱讀本文,其中對相關的SQL基礎知識進行了說明。

MIMIC 資料提取教程 - 從首次入住 ICU 的患者中提取資料。

一般來說,我們並不關心患者的所有臨床指標,所以讓我們更具體一點,比如:患者入住ICU後,如何提取第乙個WBC和SPO2值。

WBC:白細胞,對應專案編號 51300、51301

SPO2:血氧飽和度 脈搏血氧飽和度對應於 itemid 646 和 220277

涉及三個**:

1. ICUSTAY記錄所有入住ICU的患者的身份證、入住ICU的時間和離開ICU的時間。

2. LabEvents 記錄了所有患者的實驗室檢查,包括未入住 ICU 的患者。

3. ChartEvents 記錄了所有 ICU 患者的生命體徵。

目標是:都活著icu病人因此,基於icustay表中記錄的資料,三個**的共同值是受試者ID(每個患者的唯一編號),從而將三個表鏈結起來。

如圖所示,對應同乙個ICU記錄STAY ID(30000153),該患者有很多白細胞記錄,這裡我們按時間對它們進行排序。

因此,讓我們新增一列序列號。 然後讓我們選擇第乙個。

也就是說,將當前結果另存為臨時表,然後對其進行篩選。

您可以對 SPO2 執行相同的操作,只需將 labevents 表替換為 chartevents,最後將兩個表聯接起來即可。

跟隨***包括科學研究傳送"WBC 和 SPO2"獲取完整的**。

在 n**icat 中,檢索結果後會出現乙個匯出結果按鈕。

ps:有同學說**的n**icat不好用,後台回覆"n**icat"通過安裝教程獲取破解版。

支援匯出不同的格式。

另外,很多人在匯出到Excel時都會遇到這樣的錯誤,其實是因為Excel只支援65535行。 新冠剛出來的時候,不是有訊息說英國疾控部門用excel統計新冠患者資料,因為超過65535行的限制導致患者漏統計嗎?所以匯出 CSV 或其他格式不會有這個問題。

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