1045年春天，乙個外行模樣的中年人路過藏北的索曲卡，看見乙個正在辦喪事的富人，就走進院子懇求道：“我是趕事的人，想請點酒解渴。 屋主氣勢洶洶地說：“我，昌卡碧瓊，不是普通人，你一定要給我磕頭才能拿到酒。 中年男子躬身一禮，坐在一旁喝水的地上。
這時，禪卡碧瓊滔滔不絕地談論佛教，居士根本沒有禮貌地反駁。 昌卡碧瓊吃了一驚，他沒想到這個寒酸的男人竟然有這麼見多識廣，於是用疑惑的語氣問道：“我之前聽說康區有個叫鍾敦巴的居士，佛學高超，先生，不是您嗎？ 那人說：“也許是吧！ 聽到這話，他趕緊從座位上拿出乙個墊子，放在卓姆敦巴的屁股下面，同時向喇嘛獻上一匹帶緞子掛脖的好馬，請他無論如何都原諒自己的無知和粗魯，然後提議在熱仁建造一座寺院， 藏北，反正請君子來見住持。“我正要去阿里接阿底峽尊者，我現在不能答應你的請求。” 畢瓊說，那以後請你做我的福天吧！
卓敦巴（1004-1064）是拉薩以西的鬥龍人，因與繼母不和而離家出走，到處找師師學佛法。 19歲那年，他來到康區拜奉師傅，勤勤懇懇地侍奉師尊近20年，從未停止過放牛、放馬、磨麵粉、柴火的工作。 在世尊面前，他全面研讀了經籍和密經，尤其精通龍樹菩薩和阿僧的著作，在康區非常有名。
卓敦巴長途跋涉來到阿里，與阿底透一起見，獻上**作為見面禮物，阿底峽尊者為他觸控了陀螺，用梵文祈求加持、加持和灌頂。 從此以後，特魯姆·鄧巴除了乙個月從四面八方籌集資金外，再也沒有離開過師傅的身邊。 有一次，阿底峽尊者對他說：“我要把所有的佛法都傳給你。 鐘敦霸說，我沒有財力，又是新來的果子，不敢想這種事。 阿底峽尊者圓寂後，受長喀畢瓊等藏北人士的邀請，在拉薩河上游建立熱欽寺，並逐步形成以熱欽寺為祖庭的噶當派。
鐘敦巴圓寂後，他的三位著名的**博多瓦、景烏瓦、普奇瓦發揚了他們的教義，並由朗日曾巴、夏日瓦、嘉提卡瓦等傳承，信奉噶當巴的寺院遍布西藏數百年，以至於在13世紀，蒙古將軍達納波訪問**，並向苦端**報告說，在各個教派中， “噶當巴寺是最多的”。然而，後期最著名的寺院只有前西藏的熱真寺和後西藏的納塘寺。
事實上，在噶當派興起的同時，西藏時期已經形成了一股宗教力量，那就是寧瑪派。 寧瑪派是蓮花生大士傳下來的乙個教派。 寧瑪派，這是古代的意思，因為僧侶經常戴紅色的僧帽，俗稱紅色宗教。 這個教派以密宗教義為基礎，這些教義是由父親和兒子秘密傳承下來的。 正因為如此，即使在朗達瑪毀滅佛陀的時期，也沒有毀滅性的打擊。 早期的寧瑪派缺乏系統的理論，很少有代表性的寺院。 有一些咒語大師被稱為“阿巴”，他們專門為人念誦咒語，驅邪，祈雨和冰雹，這與苯教沒有什麼不同。
11世紀，在日喀則以東50公里的雅魯藏布江南岸，有三位寧瑪派大師，名叫蘇爾。 他們是大蘇爾 （Surchinpo）、他的養子小蘇爾 （Surchinwa） 和小蘇爾的小兒子 Purpa Shakyasinga。 蘇爾的三位祖先代代相傳，編纂了過去散落在民間的寧瑪派經文，制定了修行大圓滿的儀式和規範，並建造了具有代表性的五巴寺。 從那時起，在藏傳佛教領域具有影響力的寧瑪派就形成了。
在13世紀，這個家族與元朝**建立了聯絡，釋迦維被元朝的祖先忽必烈授予了“八巴什”（法師）的稱號。 還有兩位寧瑪派僧人，永屯多傑貝和桑傑扎，他們長期在元院傳授佛法，並獲得了豐厚的回報。 寧瑪派僧侶齊榮秋吉桑波將大圓滿佛法分為三個體系：心、自由和教義。 14世紀的午餐律采巴（1308-1364）是這一傳承的領軍人物，他寫了一本關於七寶的書，詳細闡述了寧瑪派的教義，成為該派僧侶的必讀書。
在蘇爾家族努力通過經文傳承教義的同時，也有一些寧瑪派僧侶非常執著地從石窟和古廟廢墟中尋找和挖掘藏族時期的密教經文。 他們相信蓮花生大士已經秘密埋葬了許多密教的書面文字，並預言他們將在幾年內再次見到曙光。 還有挖掘機的派系，Eniang Nimawise（1124-？）被稱為隱寶的上半部分，以古樂楚旺（1212-1272）為代表的隱寶的下半部分被稱為下隱寶。許多人對經文的可靠性持懷疑態度，但薩迦班智達後來在湘曲河畔發現了蓮花生大士的《性愛金剛》的梵文文字，這種懷疑被打消了不少。 古籍不全是密經，也有歷史、醫學、美術著作。
16世紀末，後藏拉杜萬戶首領扎西道傑被日喀則首領新夏派蔡丹多吉擊敗，失去了領土。 17世紀中葉，寧瑪派僧人朱美多吉在雅魯藏布江中游南岸的扎朗地區興建了民珠嶺寺，傳播“藏南”秘法，是魏藏地區寧瑪派的根本寺院。 這個教派的主要教義被稱為“九乘”：Shravaka、Rim Consciousness和Bodhisattva，統稱為三乘：做密宗、行密宗和瑜伽密宗，統稱為外三乘，以及大瑜伽密宗、無上瑜伽密宗和至尊瑜伽密宗，稱為內三乘。 寧瑪派崇拜的神佛眾多，其中最具代表性的是八位：文殊菩薩（身）。蓮花（語言）、真理（意）、甘露（功德）、金剛（事業），稱為“生五部”; 世間也有送異人、咒罵、褒獎，被稱為“三部天下”。
在11世紀，坤氏家族產生了一位名叫貢長傑布的傑出人物。 他出生於乙個叫“坤氏”的古老家庭，世世代代生活在後藏的中曲江畔。 據說，從西藏國王赤松德贊時代開始，他們就一直在修行和修行寧瑪派教義。 有一天，他去附近的乙個地方舉行儀式，看到許多當地的咒語大師戴著空女人的面具，在人群面前旋轉跳躍，表演密宗舞蹈。 他把自己所看到的告訴了在家修煉寧瑪派密宗佛教的哥哥坤。 喜悅和真誠。 我哥哥說，現在舊咒語衰落的時候，你應該換新的咒語，我聽說芒嘎有一位偉大的翻譯，他知識淵博，你應該去找他學習一些新的密宗。
貢長傑布去找卓密譯者，跟他學法多年，掌握了他獨特的“道果”法門。 然後，Kunchok Jebu在Gui Kubaladze和馬仁欽喬的指導下學習。 有一次，他看到中曲河邊的卯波山，那裡有灰白相間的土地，認為這是乙個吉祥的地方，於是他於1073年在這裡建造了薩迦北寺，當時貢長傑布只有40歲。 薩迦，意為白土，是寺院的名稱。 在薩迦寺的牆壁上，經常使用紅、白、藍三色土壤來裝飾它們，象徵著三位主，因此薩迦派通常被稱為花宗。
崑曲傑布死後，他的長子貢嘎寧波繼任寺院院長。 是他使薩迦派真正發展並形成了獨特的宗教體系。 貢嘎寧波被尊為“薩欽”（偉大的薩迦上師），是薩迦五位祖師中的第一位。 貢嘎寧波有4個兒子，次子索朗楚瑪和三子扎巴堅讚相繼繼承了法制，被稱為二祖和三祖。 63歲時，應成吉思汗孫國端的邀請，薩迦四祖是著名的薩班貢嘎堅讚，他不顧年事已高，體弱多病，毅然北上涼州（武威）達成了向蒙古汗國屈服的協議，蒙古汗國為祖國的統一做出了重要貢獻。
薩迦派在佛經方面有兩個體系，乙個是Yadrup Sangyal傳承的體系，另乙個是宗喀巴大師的老師Rindarwa Sandrolo傳承的體系。 在密教方面，有二、公、高三大宗派，主要傳承道國教義。
噶舉派的族長是瑪爾巴和密勒日巴，關於他們的事蹟有許多眾所周知的故事。 公尺拉日巴是後藏公堂（今吉隆）人，父親成為富商，卻英年早逝，留下公尺拉日巴和母親被舅舅家欺負。 為了發洩他的口臭，母親把他送到藏蓉（仁布）的地方學習黑巫術。 據說公尺拉曾經詛咒過她叔叔的許多家人，並發出冰雹摧毀他們所有的莊稼。 後來，他後悔自己的行為，前往羅扎，在噶當巴祖師瑪爾巴的指導下學習佛法，修行佛法，淨化邪惡。 起初，瑪爾巴並沒有教他佛法，而是對他進行各種懲罰性的苦役，比如命令他在高山上建房子，蓋了又拆了，拆了又建。密勒日巴忍受了各種精神和肉體的折磨，最後瑪爾巴確信他可以成為乙個偉大的工具，並把他所掌握的所有密宗教義傳授給他。
完成學業後，密勒日巴回到家鄉貢塘、尼亞蘭，在深山洞窟中繼續修煉，以苦行著稱，甚至只靠泉水和野草為生。 他最擅長的是“笨拙的火”，冬天只穿一件布大衣禦寒，所以他被稱為公尺拉日巴，意為“穿布的公尺拉”。 密勒日巴經常唱布道教育百姓，歌詞哀嘆百姓的苦難，揭露世人的不公。 他有很多男人和女人，最著名的是 Rejongba 和 Tabraj。 熱宗巴長期在山南的亞龍、龍子一帶傳教，並建立了許多禪修洞和寺院。 塔布拉杰在塔布（今山南地區嘎查縣）建立了崗布寺，在那裡他教弟子並傳授佛法。 他將噶當巴學派的教義與密宗密宗的教義融合在一起，形成了乙個基於大手印的體系，稱為禁忌噶舉。
塔布噶舉派還報告了四個主要分支和八個小分支。 四大分支分別是以中部寺（德清縣）為祖廟的噶瑪噶舉派，以蔡寺、公堂寺為祖廟的蔡巴噶舉派，以安仁巴榮寺為祖廟的八戎噶舉派，以敦薩寺（桑格里縣）為祖廟的巴珠噶舉派。帕朱噶舉有八個小分支，分別是以直貢提寺（Mozhugongka）為祖廟的直貢噶舉派，以達隆寺（林周）為祖廟的達隆噶舉派，以仁龍寺（江孜）為祖廟的巴噶舉派，以亞山寺（內東）為祖廟的雅山噶舉派， 以旭浦寺（日喀則）為祖廟的綏普噶舉派，以蜀齋寺（曲水）為祖廟的修賽噶舉派，以耶普寺（大子）為祖廟的耶巴噶舉派。四大分支的噶瑪噶舉派、直貢噶舉派、塔隆噶舉派、八小支部的朱巴噶舉派仍然活躍在各地，其餘的部落在漫長的歷史中逐漸消亡。