2023年6月，世界經濟論壇發布《2023年十大新興技術報告》，其中空間組學技術入選未來可能對世界產生巨大影響的十大新興技術之一。 作為該領域的代表，NanoString Geomx DSP通過其創新的工作流程支援空間轉錄組學和蛋白質組學的研究，該工作流程將傳統的病理學和分子分析技術與高效的資料分析相結合。
該技術的乙個關鍵優勢是它能夠處理各種具有挑戰性的樣品型別，包括甲醛固定、石蠟包埋 （FFPE） 組織切片、新鮮冷凍樣品、穿刺樣品和組織陣列陣列 （TMA）。 NanoString GeoMX DSP 能夠精確定位和定量這些樣品中蛋白質和全轉錄組的空間表達譜，從而大大加速生物標誌物的發現和疾病機制的深入分析。 該技術已在300多篇同行評審的學術出版物中得到廣泛認可和引用，顯示了其在生物醫學研究領域的重要價值和廣泛影響力。
在DSP空間多組學技術中，空間轉錄組無疑是最引人注目的領域之一。 空間轉錄組是乙個新興的研究領域，不僅關注基因表達模式，還關注這些模式在組織中的特定位置。 這對於了解細胞在不同組織環境中如何相互作用至關重要，尤其是在複雜的疾病狀態下。 空間轉錄組學的核心在於它能夠提供有關 RNA 分子在組織中的確切位置的資訊。 這對於揭示細胞間通訊機制、了解組織內微環境、探索疾病的分子基礎具有重要意義。
因此，在應用方面，DSP空間全轉錄組領域主要集中在空間原位全轉錄組或由功能單元、細胞亞群和多細胞組成的特定組織結構組成的蛋白質的表達譜。
Labex 為 DSP 空間的轉錄組提供整體解決方案
DSP空間全轉錄組技術可對人和小鼠組織進行原位全轉錄組表達分析。 WTA 方案不僅適用於常見的樣品型別，如固定石蠟包埋 （FFPE）、新鮮冷凍 （FF） 組織切片，也適用於所有組織型別。 它能夠測量每個感興趣區域 （ROI） 內的整個轉錄組，使研究人員能夠以高解像度探索組織微環境和細胞群之間的差異，以及它們背後的詳細生物學途徑。
技術原理
DSP人體空間全轉錄組優勢
DSP小鼠的空間全轉錄組優勢
應用例項
GeoMX DSP 允許您專注於不同功能的解剖學上重要的組織結構和細胞型別，並整合來自所有小鼠實驗的空間轉錄組資料，而不僅僅是少數選定的樣本。 通過大量群體分析獲得重要資訊，以揭示前後的遺傳學、器官結構、解剖特徵、組織區域和空間表達譜變化。
在GeomX DSP上對正常成年小鼠大腦的矢狀切片進行成像。 對神經元蛋白-突觸核蛋白（綠色）和DNA（藍色）進行染色，以揭示大腦的複雜組織形態，並進一步進行空間原位表達分析。 - 突觸核蛋白在突觸囊泡運輸和神經遞質中起關鍵作用。 - 突觸核蛋白的積累和聚集是帕金森病的標誌，也是目前帕金森病的重要靶點。
單元格子集定位。
使用 Geomx SpatiialDecon 反卷積演算法3 對非小細胞癌樣本進行空間分析，揭示了每個感興趣區域 （ROI） 的細胞型別及其豐度（下圖）。 研究人員可以使用預定義的細胞亞型或單細胞RNA-Seq資料來評估所得整個組織的細胞型別和豐度。
相關文章：DSP空間多組學。
Labex Classroom丨Spatial Multiomics】DSP空間多組學在腫瘤微環境中的應用。